Laboratorium Mikrobiologi Balai Besar Riset Pengolahan Produk dan Bioteknologi Kelautan dan Perikanan (BBRP2BKP). Laboratorium ini berdiri pada tahun 1968 yang secara struktural berada di bawah naungan Departemen Pertanian. Pada tahun 2006, laboratorium ini dimekarkan menjadi 2 laboratorium, yaitu: Laboratorium Mikrobiologi dan Laboratorium Bioteknologi yang berdiri secara terpisah