Balai Besar Riset Budidaya Laut dan Penyuluhan Perikanan Gondol telah menyusun kebijakan dan strategi pembangunan yang berorientasi pada hasil yang ingin dicapai sekaligus memberi arah bagi organisasi dan seluruh pegawai untuk mencapai tujuan sesuai dengan mandat yang diemban. Kebijakan dan strategi pembangunan ini memuat visi, misi, tujuan, sasaran dan program serta kegiatan yang akan dilaksanakan sesuai tugas pokok dan fungsi dengan mempertimbangkan potensi, peluang dan kendala yang ada atau yang mungkin timbul.

Visi

Terwujudnya lembaga penelitian yang terkemuka dalam penyediaan data, informasi dan teknologi budidaya laut sebagai komponen andalan pembangunan nasional kelautan dan perikanan

Misi

1. Melaksanakan penelitian dasar dan terapan bagi pengembangan budidaya laut.
2. Menciptakan teknologi unggulan dalam bidang pembenihan dan pembesaran ikan.
3. Meningkatkan pelayanan jasa kerjasama penelitian dan mengembangkan budidaya laut.
4. Meningkatkan partisipasi masyarakat dalam pengembangan IPTEK kelautan dan perikanan budidaya laut yaitu :
   1. Menghasilkan ilmu pengetahuan dan teknologi tepat guna di bidang perikanan budidaya untuk kesejahteraan masyarakat perikanan.
   2. Menerapkan teknologi inovatif dan kebijakan pada
      • Melaksanakan penelitian bagi pengembangan perikanan budidaya laut.
      • Menciptakan teknologi unggulan dalam bidang pembenihan dan pembesaran ikan laut.
      • Meningkatkan pelayanan jasa penelitian dan mengembangkan kerjasama penelitian perikanan budidaya laut.
      • Meningkatkan partisipasi masyarakat dalam pengembangkan IPTEK perikanan budidaya laut.

Keempat poin tersebut merupakan penjabaran misi dari  Pusat Penelitian dan Pengembangan Perikanan Budidaya yaitu:

• Meningkatkan partisipasi masyarakat dalam pengembangkan IPTEK perikanan budidaya laut.
• Menerapkan teknologi inovatif dan kebijakan pada sistem usaha perikanan budidaya.